当曹操接到张邈等人联名书信之时，也是十分的意外，他自己都有些不敢相信，自己“啪啪”的打了自己两下，确定不是做梦之后，当下是欣喜若狂，但是片刻之后，又犯愁起来。于是，曹操连忙召集荀彧、郭嘉、程昱等人开会，商议此事。
“张邈他们写信给我，请我前往兖州讨伐黄巾军，暂时执掌兖州，等待天子的诏令之后再行安排，你们说说吧，现在该怎么办？”曹操将书信传给他们几个。
荀彧当下站出来说道：“主公，此时当速速进取兖州，兖州无主，正是人心动荡的时刻，若是此时犹豫不定，定会让他人抢占先机啊！河北的袁绍、淮泗的杨悔，他们难道不想得到兖州吗？”
“文若所言甚是，主公，至于天子诏书，等到时候再说就是，当下先占据兖州，若是不拿下兖州，我们坐困青州一隅，仰袁绍之鼻息，是非大丈夫所为！”程昱当下也是慷慨激昂的说道，劝说曹操应该立即出兵占据兖州，至于什么天子诏书，到时候再说，地盘到手了，那些可以慢慢应付。
曹操见他们都是这般劝说自己，当下也是说出了自己的顾忌，道：“我与袁本初，乃是一衣带水，若是取兖州，袁本初必定心中不忿，如今青州之地，平原仍在袁绍手中，而且袁绍已经遣其甥高干进取并州，幽州公孙瓒迟早也会被他所灭，到时候袁绍雄踞河北，实力强劲，我何以拒之？”
曹操说的很明白了，他不是不想，而是担心得罪袁绍，青州之地，曹操控制的还不完全，平原、乐安两地其实是在袁绍的控制之下，袁绍让他的儿子袁谭为平原相，其部将管统为乐安太守，只有黄河以南几个郡才在曹操手中，其实这就是袁绍在牵制自己，一旦夺了兖州，那么到时候袁绍占据河北之后，岂能不与他拼命呢？
“主公糊涂啊，袁绍素有野心，岂能容忍主公，不单单是河北，只怕他的目标是整个大汉天下，难道主公不知道袁绍的为人吗，我们占据青州、兖州之后，可以发展实力，同时结好南面的杨悔，杨悔这个人，不是一直都很希望主公坐大吗，前番让主公夺北海之地，其实他就是希望主公坐大之后能够牵制袁绍，方便他在南方行事，所以主公不必担心袁绍，你与他之间必有一战，胜了，主公可得河北之地，与南方的杨悔南北争锋，自古南弱北强，主公定能一举匡扶天下的！”荀彧当下也很是激动的说道。
曹操见状，当下也是底气充足了不少，起身说道：“好！既如此，那就出兵兖州！”
六月，幽州牧刘虞见公孙瓒越发难以控制，于是纠合十万人进攻公孙瓒。
临行前，刘虞手下从事公孙纪，因为同姓而被公孙瓒厚待，趁夜跑到公孙瓒处告发刘虞的计划。当时，公孙瓒的部众都散布在外面，公孙瓒自觉不敌，本想逃走。结果刘虞的士兵不擅于作战，又爱惜百姓的房屋，下令不许焚烧城池，一时间竟攻不下来。公孙瓒于是召集精锐勇士数百人，顺风纵火，趁势突袭。刘虞遂大败，向北逃至居庸县。公孙瓒追击，三日城陷，抓住了刘虞，仍让他作傀儡管理州中事务。
当时正赶上朝廷派使者段训来增加刘虞的封邑，让他掌管北方六州的事务。公孙瓒借机拜为前将军，封易侯，假节督幽、并、青、冀四州，公孙瓒还诬陷刘虞之前与袁绍合谋要当皇帝，胁迫使者段训将刘虞斩首，并送首级到京都，公孙瓒得以控制幽州。
而在关中，董卓被诛以后，共部将李傕、郭汜、张济、樊稠等人忧惧不安，遣使到长安乞求赦免。时王允执掌朝政，不予赦免，讨校尉贾诩劝李傕等攻取长安，以免坐以待毙，李傕等深以为然，率军数千西行。
就在这个时候，京都盛传王允想要取代董卓，做第二个董卓，皇甫嵩、种辑、朱隽、黄琬等一干老臣站了出来，指责王允的骄横跋扈，妄图取董卓而代之，汉帝刘协也是不满王允执政之后的骄横，趁机罢黜了王允尚书令的官职，贬为太中大夫，以马日磾为太傅、皇甫嵩为车骑将军，朱隽为太尉，黄琬为司空、张温为尚书令、士孙瑞为司徒，又将先前灵帝之时重用的老臣周忠、张喜、赵岐、杨瓒等人提拔为九卿职位，掌控西京军政大事。
皇甫嵩、朱隽接手西京所有军事，收拢兵马，天子也发出明昭，西凉军旧部一律赦免，不再追究，皇甫嵩亲率吕布、徐荣等将，领三万兵马布防于渭水之畔，而李傕、郭汜数日后也带着两万旧部抵达，皇甫嵩拿出天子诏书，赦免西凉军的罪责，只追究李傕、郭汜两人的死罪，当夜，凉州军大乱，张济率军火烧大营，投靠皇甫嵩，皇甫趁势掩杀，大败凉州军，凉州军十之**都是请降，而郭汜也被部下伍习所杀，首级献给了皇甫嵩，李傕带着百余骑趁乱逃脱。
汉帝随即拜皇甫嵩为大将军，总揽全部军马，就在大汉朝廷呈现出中兴之势的时候，王允不满自己权势丢失，暗中勾结吕布叛变，企图杀皇甫嵩等人，吕布部将趁机将消息告诉了皇甫嵩，皇甫嵩上表天子，随即擒拿吕布和王允，两人趁机逃出了长安，投山东而去，不知所踪。
而杨悔也顺利的控制了沛国、梁国两地，将沛国一分为二，竹邑以北为沛郡，竹邑以南为淮北郡，且将原汝南郡靠淮水的四县划出，与庐江郡泄水西北的五县合并为安丰郡，各遣郡守治理。
而交州之地，朱符的行为引起了交趾太守士燮的不满，联合当地土著击杀朱符，同时鲁肃已经攻占龙川，士燮遣使将朱符劫掠的庐陵百姓归还，与杨悔修好。
孙策在桂阳郡与刘表军鏖战三月，互有胜负，刘磐退防攸县，孙策占据桂阳郡，周瑜也是在樊口率水师大败黄祖，黄祖退守夏口，周瑜率军劫江夏三千户百姓如豫章，退守鄱阳湖。
六月青州黄巾军近百万人向兖州腹地进击，攻下任城，又在东平附近，大破前来镇压的官军，陈留太守张邈、济北相鲍信等人迎曹操出任假兖州刺史，遣治中万潜与鲍信亲至齐国迎接曹操，曹操率兵和鲍信合军进攻黄巾军，鲍信不幸战死，曹操“设奇伏，昼夜会战”，终于将黄巾击败，两月之间，获降卒二十余万，人口今百万，曹操收其精锐，组成军队，一时间亦是实力大增。
与此同时，长安朝廷闻知刘岱战死，任命京兆尹金尚为兖州刺史，曹操派心腹于途中迎击金尚，金尚猝不及防，仓皇西逃，于是曹操占兖州。朝廷得知之后，也是无奈，遣朱隽驻守荥阳，扼控关陇，严防各地诸侯西犯。
天下局势也是越发的明朗起来，公孙瓒占据幽州，袁绍占据冀州、并州，曹操占据兖州、青州，杨悔占据徐州、扬州、豫州东部，刘表各据荆州，刘焉各据益州，汉廷偏居关陇之地，除此之外，就是袁术偏居颍川、南阳北部之地，交州之地被士燮兄弟掌控，分掌州郡。